Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ss18Q62280 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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