Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms