Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms