Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms