Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

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Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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VcanQ62059 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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VcanQ62059 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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VcanQ62059 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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VcanQ62059 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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VcanQ62059 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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VcanQ62059 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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VcanQ62059 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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VcanQ62059 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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VcanQ62059 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VcanQ62059 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VcanQ62059 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VcanQ62059 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VcanQ62059 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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