Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc2Q62029 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc2Q62029 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms