Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctr9Q62018 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms