Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms