Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxj1Q61660 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxj1Q61660 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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