Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Hes3Q61657 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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