Protein–RNA interactions for Protein: Q61458

Ccnh, Cyclin-H, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnhQ61458 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcnhQ61458 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnhQ61458 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms