Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsx2Q61412 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms