Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms