Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp4Q61107 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp4Q61107 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms