Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Neurod1Q60867 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms