Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a4Q60857 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms