Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3Q60803 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms