Protein–RNA interactions for Protein: Q60754

Marco, Macrophage receptor MARCO, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MarcoQ60754 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MarcoQ60754 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms