Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf4Q60722 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf4Q60722 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf4Q60722 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf4Q60722 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf4Q60722 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf4Q60722 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf4Q60722 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf4Q60722 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf4Q60722 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf4Q60722 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf4Q60722 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf4Q60722 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf4Q60722 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf4Q60722 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms