Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samhd1Q60710 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms