Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms