Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms