Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpbQ60649 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpbQ60649 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpbQ60649 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpbQ60649 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpbQ60649 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpbQ60649 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpbQ60649 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpbQ60649 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ClpbQ60649 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpbQ60649 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpbQ60649 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ClpbQ60649 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpbQ60649 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClpbQ60649 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClpbQ60649 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpbQ60649 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms