Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CttnQ60598 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CttnQ60598 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CttnQ60598 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms