Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3aQ60520 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms