Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms