Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc11Q5U458 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms