Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms