Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV8

Pfpl, Pfpl protein, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfplQ5RKV8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PfplQ5RKV8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms