Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RilpQ5ND29 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RilpQ5ND29 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms