Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scarf1Q5ND28 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scarf1Q5ND28 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms