Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps41Q5KU39 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms