Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkaa1Q5EG47 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms