Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms