Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl6Q505G4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rtl6Q505G4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rtl6Q505G4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rtl6Q505G4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rtl6Q505G4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rtl6Q505G4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rtl6Q505G4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rtl6Q505G4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rtl6Q505G4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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