Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Slc27a5Q4LDG0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Slc27a5Q4LDG0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Slc27a5Q4LDG0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Slc27a5Q4LDG0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Slc27a5Q4LDG0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Slc27a5Q4LDG0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Slc27a5Q4LDG0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Slc27a5Q4LDG0 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Slc27a5Q4LDG0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Slc27a5Q4LDG0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Slc27a5Q4LDG0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Slc27a5Q4LDG0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Slc27a5Q4LDG0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc27a5Q4LDG0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Slc27a5Q4LDG0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms