Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt35Q497I4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms