Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lin28bQ45KJ6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lin28bQ45KJ6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lin28bQ45KJ6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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