Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Fam220aQ3ZN08 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Fam220aQ3ZN08 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Fam220aQ3ZN08 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Fam220aQ3ZN08 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Fam220aQ3ZN08 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Fam220aQ3ZN08 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Fam220aQ3ZN08 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fam220aQ3ZN08 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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