Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim26Q3V460 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms