Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pydc3Q3V3Q4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms