Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms