Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms