Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ttc9Q3V038 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ttc9Q3V038 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ttc9Q3V038 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ttc9Q3V038 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ttc9Q3V038 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ttc9Q3V038 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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