Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Kdm5aQ3UXZ9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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