Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pfdn4Q3UWL8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn4Q3UWL8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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