Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D130052B06RikQ3UW13 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D130052B06RikQ3UW13 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms