Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm29609Q3UU56 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm29609Q3UU56 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm29609Q3UU56 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm29609Q3UU56 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gm29609Q3UU56 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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