Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm10Q3UTQ7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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