Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS3

Drc1, Dynein regulatory complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Drc1Q3USS3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Drc1Q3USS3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Drc1Q3USS3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms